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肿瘤界“顶峰之作”:美国重磅推出“泛癌症图谱”服务全人类

【本文为疾病百科知识,仅供阅读】  2018-04-10  作者:厚朴方舟  

较近真是好消息不断:《FDA授予肺癌新药dacomitinib优先审评资格,有望成为一线治疗方法》;《传奇抗癌药LOXO-101前沿研究数据公布:对部分癌症治效果果对比高达93%》;《世界初次!通过来自心脏的“留言”来预防癌症转移》(可点击厚朴方舟主页查看相关文章)......

这几天,又一条重磅新闻震惊了整个肿瘤界:通过对33种较常见癌症超过11000个肿瘤样本的分析,一份关于癌症的“世界地图”正式上线。这项凝聚了全世界无数权威肿瘤学家10多年工作的精华,发表在了27篇论文上,涵盖权威学术期刊《细胞》及其一系列子刊。

肿瘤界“权威之作”:美国重磅推出“泛癌症图谱”服务全人类

▲前沿一期闻名学术期刊《Cell》以封面形式聚焦泛癌症图谱(Pan-Cancer Atlas)

该项目是由国立卫生研究院(NIH)的两个研究机构同时赞助,即国家癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所。全美超过二十多个研究机构的150多位研究人员参与了这项耗资3亿美元的项目。

美国国立卫生研究院院长Francis S. Collins博士说:“这个项目是10多年来突破性工作的结晶!为癌症研究人员提供了前所未有的工具,让他们理解肿瘤在人体内如何诞生、何处诞生、为何诞生,并能更好地指导临床试验,使更好的治疗方法成为可能。”

具有里程碑意义的“TCGA”

不夸张地讲,这个被称为“癌症大地图”(Pan-Cancer Atlas)的项目,是癌症研究领域的一大里程碑。而它的启动与完成,则离不开科学家们如匠人一般,细致地描绘出地图的每个细节。

泛癌症图谱项目被分为三大类别,每种类别都由一篇总结性论述对其核心内容进行概括和引申讨论,核心主题内容包括:癌细胞起源、致癌过程和途径以及癌细胞信号传导通路等。多篇同期论文发表了对三大类别中的其他主题也进行了深入挖掘和探讨其研究成果。

在研究之初,科学家们首先依照解剖学的角度,从人体的乳腺、肾脏、肺部等不同部位分离出了肿瘤的样本。随后,利用多种权威的技能平台,研究人员用细胞和遗传组成来对这些肿瘤进行进一步的区分。用已经显得有些陈旧的观点看,这些肿瘤来自33种不同的部位。但根据肿瘤的分子特征,它们实际上要被重新划分成28类。

这些分类颠覆了过去我们对肿瘤的认知。分析结果表明,许多看似不同的癌症,在根源上其实有着极高的相似性。举例来说,一些带有特定分子特征的类别,竟包括了25种(解剖学上)不同的肿瘤。这能让研究人员的目光透过肿瘤病发部位这一表象,直击癌症的较初根源。

更棒的是,这些分子分析结果与大量临床研究结合了起来,让我们能够理清不同的治疗方法对于特定类别的癌症,能有怎样的效果。这些数据将对全球所有的医生和研究人员公开。

在专家们看来,这个项目将直接造福于癌症研究与癌症新药的开发。“这些前沿的成果有望让医药公司开发全新的癌症免疫治疗方法方法,或是让已经获批、治疗其他疾病的药物用于癌症的治疗。”加州大学旧金山分校(UCSF)的癌症与发育治疗方法项目主任 Christopher Benz教授评论道。

在基于癌症基因组的分析之外,这一系列研究还综合了癌症转录组、蛋白质组、甲基化组、临床数据、以及癌症医学影像。通过整合不同的数据类型,研究人员们相信这可以挖掘出关键的洞见,带来实际可用的信息。

“是时候重写癌症的教科书了!”Benz教授兴奋地说道。

所有关于“泛癌症图谱”发表的研究成果和论文都可以通过《Cell》官网上获得。此外,随着长达十年的“TCGA”项目的正式结题,该项目组牵头机构预期计划举办一个为期3天的专题学术研讨会,主题是“TCGA”的丰功伟绩:癌症多组学的精准研究。研讨会拟定2018年9月27-29日在华盛顿特区举行。

肿瘤界“权威之作”:美国重磅推出“泛癌症图谱”服务全人类

▲泛癌症图谱(Pan-Cancer Atlas)的重磅文章收录网站(图片来自CellPress)

研讨会届时将着重探讨癌症研究的未来发展方向,并讨论“泛癌症图谱”的指导意义,与此同时,还将展示癌症基因组结构前沿进展和近期靶向治疗进展等。

参考文献:

1. Charting a Course to a Cure

2. The Cancer Genome Atlas: CreatingLasting Value beyond Its Data

3. Cell-of-Origin Patterns Dominate theMolecular Classification of 10,000 Tumors from 33 Types of Cancer

4. Perspective on Oncogenic Processes atthe End of the Beginning of Cancer Genomics

5. Oncogenic Signaling Pathways in TheCancer Genome Atlas

6. Machine Learning Identifies StemnessFeatures Associated with Oncogenic Dedifferentiation

7. Pathogenic Germline Variants in 10,389Adult Cancers

8. Comprehensive Characterization of CancerDriver Genes and Mutations

9. A Pan-Cancer Analysis of EnhancerExpression in Nearly 9000 Patient Samples

10. An Integrated TCGA Pan-Cancer ClinicalData Resource to Drive High-Quality Survival Outcome Analytics


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Colin Weekes教授在波士顿哈佛医学院的血液学/肿瘤学系任职,同时是麻省总医院Tucker Gosnell胃肠癌中心胰腺癌医学肿瘤研究主任,专注于胰腺癌患者的临床和转化研究,他所带领的研究小组的目标是将生物学原理纳入胰腺癌患者的治疗中。目前他正在与基础科学家合作,旨在将靶向治疗和疾病反应的生物标志物整合到临床试验开发中。 除了从事胰腺癌的工作外,Weekes博士还致力于胃肠道恶性肿瘤的早期药物开发。他的临床兴趣包括胰腺癌,结肠癌和直肠癌,以及肝癌,包括胆管癌和肝细胞癌。他可以治疗多种类型的癌症患者,包括结肠直肠癌,食道癌,胆囊癌,胃肠道癌,肝癌和胃癌。 履历 Colin W
【医学教育】 •麻省大学医学院医学博士 •布莱根妇女医院住院医生 •丹娜法伯癌症研究所专科培训 美国委员会认证 •内科医学,美国内科医学委员会 •美国内科医学委员会肿瘤内科 【关于劳拉·斯普林医生介绍】 Spring医生是麻省总医院癌症中心和哈佛医学院的临床试验/翻译研究人员和乳腺癌肿瘤专家。她获得了内科和内科肿瘤学的董事会认证。 Spring医生完成了在布莱根妇女医院的住院医

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